ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2534 มีการลงประชามติทั่วประเทศในสหพันธรัฐรัสเซียจากนั้นเป็นส่วนหนึ่งของสหภาพโซเวียตอันเป็นผลมาจากการที่สถาบันตำแหน่งประธานาธิบดีปรากฏในสาธารณรัฐ การจัดตั้งตำแหน่งประธานาธิบดีเกิดจากลักษณะเฉพาะของสถานการณ์ทางเศรษฐกิจและการเมือง ซึ่งจำเป็นต้องเสริมสร้างอำนาจบริหารให้เข้มแข็ง ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2534 สาธารณรัฐได้รับประธานาธิบดีคนแรกซึ่งกลายเป็นบี.เอ็น. เยลต์ซิน
ก่อนเข้ารับตำแหน่งประธานาธิบดี
ความนิยมของบอริส เยลต์ซินในกลุ่มประชากรในวงกว้างเริ่มเพิ่มขึ้นตั้งแต่ปี 2530 เมื่อในฐานะเลขาธิการคนแรกของคณะกรรมการพรรคเมืองมอสโก เขาเข้าสู่ความขัดแย้งอย่างเปิดเผยกับผู้นำส่วนกลางของ CPSU คำวิจารณ์หลักจากเยลต์ซินถูกกำกับโดย M. S. Gorbachev เลขาธิการคณะกรรมการกลาง
ในปี 1990 บอริส เยลต์ซินกลายเป็นรองผู้แทน RSFSR และเมื่อปลายเดือนพฤษภาคมของปีเดียวกันเขาได้รับเลือกเป็นประธานสภาสูงสุดของสหภาพโซเวียตแห่งสาธารณรัฐ ไม่กี่วันต่อมา ปฏิญญาอธิปไตยของรัสเซียก็ถูกนำมาใช้ โดยมีเงื่อนไขว่ากฎหมายของรัสเซียมีความสำคัญเหนือกฎหมายของสหภาพโซเวียต ที่เรียกว่า "ขบวนแห่อำนาจอธิปไตย" เริ่มขึ้นในประเทศที่เริ่มแตกสลาย
ในที่สุดในประวัติศาสตร์ของ CPSU สภาคองเกรส XXVIII บอริส เยลต์ซินก็ออกจากตำแหน่งพรรคคอมมิวนิสต์อย่างแสดงให้เห็น
ในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2534 บอริส เยลต์ซินกล่าวสุนทรพจน์ทางโทรทัศน์ วิพากษ์วิจารณ์นโยบายของผู้นำระดับสูงของสหภาพโซเวียตอย่างรวดเร็ว เขาเรียกร้องให้กอร์บาชอฟลาออกและโอนอำนาจทั้งหมดไปยังสภาสหพันธ์ หนึ่งเดือนต่อมามีการลงประชามติทั่วประเทศในสหภาพโซเวียตซึ่งผลลัพธ์ที่ได้ก็คลุมเครือ ประชากรส่วนใหญ่ของประเทศสนับสนุนการรักษาสหภาพโซเวียตในขณะเดียวกันก็แนะนำการปกครองของประธานาธิบดีในรัสเซีย นี่หมายความว่ามีไดอารี่เข้ามาในประเทศ
ประธานาธิบดีคนแรกของสาธารณรัฐ
เมื่อวันที่ 12 มิถุนายน พ.ศ. 2534 การเลือกตั้งประธานาธิบดีครั้งแรกใน RSFSR ได้จัดขึ้นในประวัติศาสตร์ของรัสเซีย ชัยชนะในรอบแรกชนะโดยบอริส เยลต์ซิน ซึ่งไปร่วมการเลือกตั้งร่วมกับอเล็กซานเดอร์ รุตสคอย ซึ่งในที่สุดก็ได้เป็นรองประธานาธิบดี และสองเดือนต่อมา เหตุการณ์ในประเทศที่นำไปสู่การล่มสลายของสหภาพโซเวียต
เมื่อวันที่ 19 สิงหาคม พ.ศ. 2534 นักการเมืองหลายคนจากวงในของมิคาอิล กอร์บาชอฟ ประกาศว่ามีการจัดตั้งคณะกรรมการสถานการณ์ฉุกเฉินแห่งชาติขึ้นในประเทศ เยลต์ซินพูดกับคนรัสเซียทันที โดยเรียกร้องให้การเคลื่อนไหวครั้งนี้เป็นการพยายามทำรัฐประหาร ในช่วงหลายวันของการเผชิญหน้าทางการเมือง เยลต์ซินได้ออกกฤษฎีกาหลายฉบับที่ขยายอำนาจประธานาธิบดีของเขา
เป็นผลให้ประธานาธิบดีรัสเซียคนแรกได้รับชัยชนะที่น่าประทับใจตามมาด้วยการล่มสลายของสหภาพโซเวียต
ในปีถัดมา เหตุการณ์ทางการเมืองที่สำคัญมากมายเกิดขึ้นในรัสเซีย ซึ่งประธานาธิบดีคนแรกของสาธารณรัฐมีส่วนร่วมโดยตรง ในปี 1996 เยลต์ซินได้รับเลือกให้ดำรงตำแหน่งสูงสุดในรัสเซียอีกครั้ง ในตอนท้ายของปี 2542 บอริสเยลต์ซินลาออกจากตำแหน่งประธานาธิบดีอย่างเป็นทางการและสมัครใจโดยโอนอำนาจก่อนสิ้นสุดตำแหน่งประธานาธิบดีไปยังผู้สืบทอดซึ่งกลายเป็น V. V. ปูติน.