ตามประเพณีของโบสถ์เก่า วิหารส่วนใหญ่ที่สร้างขึ้นในสไตล์โกธิกเป็นคาทอลิก แต่มีข้อยกเว้นสำหรับกฎนี้ มหาวิหารกอธิคที่ใหญ่ที่สุดในโลก สร้างขึ้นในนิวยอร์กซิตี้ ไม่ใช่นิกายโรมันคาธอลิก เขาไม่ใช่โปรเตสแตนต์เช่นกัน เรียกว่าเอปิสโคปัล
การก่อสร้างมหาวิหารเริ่มขึ้นเมื่อปลายปี พ.ศ. 2435 ในสไตล์ไบแซนไทน์ จากนั้นหลังจากที่อธิการแห่งความเชื่อมั่นอื่น ๆ เข้ามาเป็นผู้นำ พวกเขาก็เริ่มสร้างมันขึ้นใหม่ตามประเพณีทางสถาปัตยกรรมของนิกายโรมันคาธอลิกให้แม่นยำยิ่งขึ้นตามภาพของ French Gothic ฐานของวิหารเป็นรูปไม้กางเขน ด้านซ้ายและด้านขวาของทางเข้ากลาง มีการวางแผนที่จะสร้างหอคอยสองหลัง ซึ่งคล้ายกับหอคอยของมหาวิหารน็อทร์-ดามที่มีชื่อเสียงในปารีส ความคล้ายคลึงนี้ควรเสริมด้วยส่วนโค้งแหลมของประตูหลัก รูปปั้นนักบุญตามผนัง และหน้าต่างกุหลาบที่มีหน้าต่างกระจกสีเหนือประตูหลัก
ขนาดของมหาวิหารนั้นน่าทึ่งมาก เขาใหญ่จริงๆ พื้นที่ทั้งหมดเป็นสนามฟุตบอลสองสนาม หน้าต่างกุหลาบที่ประกอบขึ้นจากกระจกสีนับพันชิ้น เส้นผ่าศูนย์กลางมากกว่า 12 เมตร ในเวลาเดียวกัน มหาวิหารสามารถรับผู้เชื่อได้ 5 พันคน
ขนาดมหึมาของมหาวิหารเป็นผลมาจากความทะเยอทะยานของตัวแทนของโบสถ์เอพิสโกพัลแห่งนิวยอร์ก ในปี พ.ศ. 2421 ชาวคาทอลิกในเมืองได้สร้างโบสถ์เซนต์แพทริกในสไตล์นีโอโกธิค ในขณะนั้น มหาวิหารคาธอลิกแห่งนี้ใหญ่ที่สุดในนิวยอร์ก ตัวแทนของโบสถ์เอพิสโกพัลตัดสินใจแซง "คู่แข่งทางศรัทธา" ของพวกเขา และสร้างอาสนวิหารเอพิสโกพัลที่มีขนาดใหญ่เป็นสองเท่า
อย่างไรก็ตาม การก่อสร้างวิหารล่าช้า การรับบริจาคในลักษณะที่ไม่เป็นมิตร ในตอนต้นของศตวรรษที่ 20 มีเพียงรากฐานเท่านั้นที่พร้อม พิธีถวายอาสนวิหารที่ยังสร้างไม่เสร็จเกิดขึ้นในปี พ.ศ. 2484 หลังจากที่สหรัฐอเมริกาเข้าสู่สงครามโลกครั้งที่สอง เงินทุนทั้งหมดของโบสถ์เอพิสโกพัลได้ไปบริจาคเพื่อการกุศลในลักษณะที่แตกต่างออกไป และหลังสงครามการก่อสร้างก็ยังไม่คืบหน้ามากนัก มหาวิหารยังคงมีหอคอยเพียงแห่งเดียว
ในปี 2544 เกิดเพลิงไหม้ที่สถานที่ก่อสร้างของมหาวิหาร ร่องรอยของไฟที่ทำลายล้างนั้นถูกลบออก วันนี้อาสนวิหารพร้อมแล้วสองในสาม แม้จะมีการก่อสร้างหอคอยแห่งเดียวที่ยังไม่เสร็จ แต่ผู้เชื่อประมาณครึ่งล้านมาเยี่ยมชมโบสถ์เซนต์จอห์นนักศาสนศาสตร์ทุกปี เพื่อดึงดูดพวกเขา พ่อของโบสถ์เอพิสโกพัลไม่ได้จำกัดและใส่สมบัติต่าง ๆ ไว้ในมหาวิหาร ตัวอย่างเช่น พรมทอจากศตวรรษที่ 17-18 ที่พรรณนาถึงความรักของพระคริสต์ ภาพวาดโดยศิลปินที่มีชื่อเสียง ของขวัญต่างๆ ที่นำมาจากสถานที่ศักดิ์สิทธิ์ของโลก
โบสถ์แห่งนี้ยังมีอนุสาวรีย์ของผู้ที่ตกเป็นเหยื่อของประวัติศาสตร์คริสเตียนอีกด้วย สวนในพระคัมภีร์ไบเบิลของมหาวิหารยังดึงดูดผู้ศรัทธาด้วย ซึ่งพืชทั้งหมดที่กล่าวถึงในพระคัมภีร์นั้นถูกปลูกไว้